دفعت هيئة الدفاع عن المتهمين، في القضية الملفقة المعروفة إعلاميًا بـ”غرفة عمليات رابعة”،  والمتهم فيها الدكتور محمد بديع المرشد العام لجماعة الإخوان المسلمين و50 آخرين من  قيادات وأعضاء الجماعة، بعدم صلاحية رئيس المحكمة المستشار محمد ناجى شحاته لنظر الدعوى .

واستند هيئة الدفاع، في دفوعه إلى إفصاح رئيس المحكمة محمد ناجي شحاتة عن رأيه  السياسي من خلال تصريحات صحيفة أكد خلالها ميوله لقائد الإنقلاب عبد الفتاح السيسى  بما يحول دون مبدأ استكماله لوقائع الدعوى.
 
وكان أحد أعضاء هيئة الدفاع عن المتهمين، قد قام بسرد حوار تليفزيونى لرئيس المحكمة  محمد ناجى شحاتة، قائلاََ «إن رئيس المحكمة قال نصاً لو استمر الإخوان فى الحكم  لكان مصيرى السجن» فرد عليه القاضي: «ماكنتش هتسجن لوحدى».