أكد الانقلابي تواضروس الثاني بابا الأقباط الأرثوذكس بمصر والشرق الأوسط على أن "الكنيسة الأرثوذكسية تصلي من أجل أن يبارك الله كل خطوات قائد الانقلاب عبد الفتاح السيسي".
وقال تواضروس في عظته الأسبوعية الأربعاء، بالكاتدرائية المرقسية بالعباسية: "نهنئ الرئيس عبد الفتاح السيسي ببدء السنة الثانية لانتخابه رئيسا لكل المصريين، وباسمكم كلكم أرسلنا برقية باسم الكنيسة لتهنئته ونصلى أن يبارك الله كل خطواته".
كان تواضروس قد سخر الكنيسة وحشد الأقباط لمساعدة قادة الجيش في الانقلاب علي الرئيس المنتخب محمد مرسي، وظهر في إعلان الانقلاب بجوار عبد الفتاح السيسي.

